Система державних фітосанітарних заходів з охорони країни від проникнення небезпечних шкідників, збудників хвороб, бур’янів та інших шкідливих організмів, відсутніх на її території, що становлять потенційну економічну загрозу рослинним ресурсам, а також заходів, спрямованих на своєчасне виявлення, локалізацію та ліквідацію вогнищ зараження. К. р. – це суверенне право країни запобігати завезенню, самост. проникненню з-за кордону і поширенню карантин. організмів на території, де вони відсутні. Є важливою ланкою загальної системи захисту рослин.
Карантинна служба країни-експортера зобов’язана кожну партію товарної продукції супроводжувати карантинним фітосанітарним сертифікатом. Підкарантинні вантажі, тара і транспортні засоби, що їх перевозять, у пунктах перетину кордону підлягають первинному огляду. Карантинні лабораторії здійснюють експертизу зразків вантажів. Заражену партію вантажу знезаражують, знищують або повертають назад. Приховане зараження посівного чи посадкового матеріалу виявляють під час випробування або пророщування зразків в інтродукційно-карантинних розсадниках та оранжереях. Вторин. карантин. огляд і контроль здійснюють карантинні інспектори в пунктах призначення при вивантаженні, зберіганні, переробленні й використанні завезених матеріалів. Серед заходів внутрішнього карантинного режиму – періодичні карантинні обстеження певних районів або посівів різних культур на наявність карантинних шкідників, зараженість збудниками хвороб чи присутність бур’янів, контроль переміщення вантажів рослинного походження в країні. Під час обстеження виявляють вогнища зараження, визначають їхні межі та здійснюють заходи з локалізації чи ліквідації.